identificação e desenvolvimento de marcadores moleculares para a seleção genómica no porco ibérico

O que fazemos

Atualmente, a identificação de marcadores genéticos nos animais domésticos, as espécies com genomas complexos, facilita-se em grande medida pela grande quantidade de dados de sequência que podem ser produzidos utilizando tecnologia de sequenciação de alto rendimento (NGS-sequenciação de próxima geração). No contexto porco ibérico, é possível identificar milhares posteriormente SNPs avaliação do seu efeito nas características fenotípicas de interesse económico como o crescimento, pela produtividade suína e qualidade da carne, com o objetivo de identificar marcadores genéticos implicados na regulação genética destas características. Foi estudado e caracterizado a variação genética presente nos genomas de 2.000 indivíduos.

A identificação e validação de marcadores moleculares associados com os fenótipos estudados estará disponível para a sua utilização no programa de melhoramento da fileira, na qual se incorpora a informação destes marcadores, juntamente com os registos fenotípicos e pedigree. Esta avaliação genética irá então permitir a identificação precoce dos animais portadores dos genótipos mais favoráveis associados com melhores atuações destas características produtivas, o que irá beneficiar os produtores.

Além disso, também irá desenvolver um sistema de seguimento baseado na identificação de SNPs específicos para as diferentes linhas de porco ibérico e outras raças de porcos. Este sistema será uma ferramenta muito poderosa para a rastreabilidade molecular dos produtos baseados nestas fileiras, a criação de um mecanismo para proteger os produtores de fraude potencial e garantir a segurança alimentar aos consumidores.

A proposta baseia-se na utilização da tecnologia de sequenciação avançada (NGS) para identificar a variação genética (SNPs) presente em cada grupo de animais estudados. Posteriormente, a análise estatística será determinado o efeito de cada SNP no fenótipo de interesse, e portanto identificados os marcadores moleculares associados com as atuações produtivas melhoradas.

Quem participa

Coordena: CEBAL
Parceiros participantes: CEBAL e CICYTEX

Como o fazemos

• Identificação de marcadores moleculares para a taxa de crescimento
• Identificação de marcadores moleculares para produtividade
• Caracterização genética de uma população da linha Valdesequera
• Desenvolvimento de um sistema de rastreabilidade molecular de porco ibérico
• Desenho e implementação de uma base de dados integrada

Contactos

Coordenador da atividade: António Marcos Ramos (CEBAL) | marcos.ramos@cebal.pt